南阳市中医院为国家三级甲等中医医院，附设“南阳市中西医结合儿童医院”、“南阳市中西医结合骨伤医院”和“南阳市椎间盘病诊疗中心”、“南阳市中毒诊疗中心”、“南阳市微创外科（腔镜）治疗中心”、“南阳市肾病透析中心”、“南阳市溯源司法鉴定所”等机构，开放病床800张。

医院拥有进口原装1.5T光纤磁共振、德国西门子128能谱CT、四维彩超、800mAX光机、电子胃镜、电子结肠镜、全自动生化分析仪、同步呼吸机、腹腔镜、钬激光、液晶碎石机、高端血液透析机、冷极射频肿瘤治疗机、中药浓缩提取等大型诊疗设备200余台。内设急诊、心血管、肿瘤、脑病、老年病、肾病呼吸、肝胆脾胃、骨伤、妇产、儿科、普外、胸外、脑外、微创外科、腔镜外科、重症医学科（ICU）、烧伤整形、耳鼻喉头颈外科、口腔科、眼科等28个优势病区；针灸推拿、肛肠、皮肤、糖尿病等30多个特色专科。医院名医荟萃，专科齐全，设备先进，服务优质，形成了“中医有特色，西医有品牌，中西医结合有优势”的发展格局。

2019年以来，医院先后被批准为河南省区域中医儿科诊疗中心、国家区域中医骨伤科诊疗中心。医院已与北京中医医院等10余家国家级名牌医院建立长期技术协作关系，并与中国中医科学院北京望京医院共同建设国家中医（骨伤）区域医疗中心项目。医院的整体技术实力与优质服务水平跃居全市前列，为广大人民健康提供了强有力的保障。

目前，南阳市中医院新院区拟总占地470亩，总建筑规模30万平方米，总投资17.9亿元。一期工程已获批在建，建成后医院床位可达3000张。医院还将建立建强“一馆六院多中心”。一馆即仲景馆，把门诊做大做强；“六院”是以建设区域医疗中心为契机，打造六个“院中院”，即骨伤医院、脑病医院、儿童医院、肛肠医院、肿瘤医院和康复医院；“多中心”即升级胸痛中心、治未病中心、透析中心、体检中心和信息技术中心等，做好急救、康复和健康管理工作，力争用2-3年时间，医院进入全省前列。